益生菌的「糞便」短鏈脂肪酸，能調整免疫系統、抑制發炎過敏
林口長庚營養治療科營養師盧珈伶表示，短鏈脂肪酸泛指碳鏈少於6個碳的脂肪酸，可經由靜脈進入血液循環，提供人體5～10%的能量來源。
腸內的益生菌對身體有諸多好處。擅長分子營養療法與腸內菌群的日本醫師桐村里紗表示，這些益生菌以水溶性膳食纖維等營養為食後，會產出「糞便」，雖然這些「糞便」並非全部都為短鏈脂肪酸，但和人體健康息息相關的以酪酸、丙酸、乙酸等短鏈脂肪酸為典型。桐村里紗進一步解釋，益生菌在腸內居住，不僅能使排便順暢，也可以強化腸道屏障機能，使過敏物質等不至於侵入人體。而短鏈脂肪酸中的酪酸也對免疫系統有所幫助。
根據日本理化學研究所所做的研究，腸內細菌所分泌的酪酸，吸收至體內後，能增加調節性T細胞的數量。該細胞為是T細胞的煞車系統，能終止免疫反應，以抑制發炎或過敏的現象。
短鏈脂肪酸對人體好處多多
除了前述提及的調整免疫反應之外，桐村里紗監修的文章還指出短鏈脂肪酸有以下的作用：
將腸內環境調整為適合益生菌
益生菌容易生活在弱酸性的環境，相對的，壞菌較容易生活在鹼性的環境。由於分泌短鏈脂肪酸能使腸內變為弱酸性，除了讓益生菌容易存活外，還能抑制壞菌繁殖。
消除便秘並提高屏障機能
短鏈脂肪酸能讓大腸蠕動變得活潑，並使排便順暢。此外，還可以修復腸壁的上皮細胞，維持腸黏膜健康，提高屏障機能。
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