泡菜（中式發酵甘藍菜）
泡菜是一種中國的傳統發酵蔬菜，在中國餐廳中常被作為一種開胃冷盤。如同韓式泡菜一般，泡菜的製作方式為醃漬健康的蔬菜：甘藍菜、白蘿蔔、芥菜莖（mustard green stems）、紅蘿蔔和薑。參與泡菜發酵過程的細菌有許多與健康人體的微生物體相同，包括厚壁菌門和乳酸菌屬，它們是泡菜中的優勢品種。
中國陝西師範大學（Shaanxi Normal University）進行的科學研究發現泡菜含有多達三十種不同的細菌品種，使它成為一種益生菌豐富的食物。泡菜中的甘藍菜也是一種膳食纖維的來源，一杯就相當於每日纖維建議攝取量的九％。在中國，這些醃漬的蔬菜通常是配白飯享用。
起司
當談到微生物體，起司對你的腸道很好。起司由牛奶、一種稱為凝乳酶（rennet）的酵素及發酵菌元（starter culture）所製成。酵種（starter）是根據要製作的起司種類而由不同的細菌類型組成。這些細菌會產生乳酸（lactic acid），並且與酵素一同將牛奶轉變為凝乳（curds）和乳清（whey），接著再經過多種步驟，才會形成擁有獨特風味和質地的傳統及商業起司。
每種起司都具有自己的微生物體，這是發酵菌元與起司的製造地區和成熟環境（如：起司地窖）三者加乘的結果。在起司熟成的數週、數月，甚至是數年之間，許多生物，從細菌、黴菌到酵母菌都會定居並大批地進入起司，造就了它的風味及它本身的「起司微生物體。」當我們吃起司時，我們正嚥下活菌以及細菌製造的產物，兩者皆對我們的健康有益。
帕瑪森乾酪（Parmigiano-Reggiano）是一種源於義大利帕瑪的美味傳統硬質起司，製成巨型圓盤形狀，在販售和食用前需要熟成一到兩年。儘管在製作的頭幾個月，起司中會存在多種細菌，但隨著起司成熟，酸度也跟著改變，當起司可以販售時，許多細菌已經消失。活著的細菌為乾酪乳桿菌（Lactobacillus casei）和鼠李糖乳桿菌。兩者皆被觀察到有對抗胃腸炎、糖尿病、癌症、肥胖，甚至是產後憂鬱症的有益活性。帕瑪森乾酪是一種益生菌的天然來源。
由牛奶製成的高達起司是另一種益生菌特性已經被研究的起司。高達起司含有維生素K2（甲萘醌類），具有抗血管新生的活性。它也具有超過二○個品種的多樣微生物體，包括胚芽乳酸桿菌和乾酪乳桿菌，隨著起司成熟，細菌居民也跟著改變。
在歐洲，高達是由生乳（raw milk）製造，但是在美國卻是一種經過巴氏殺菌的產品。比利時根特大學（Ghent University）及農業和漁業研究所（Institute for Agriculture and Fisheries）的研究顯示相較於巴氏殺菌過的起司，使用生乳製成的高達起司含有更多樣化的細菌，這是一種有益的特性。雖然使用生乳製成的起司在其原產國受到重視，但是美國的食品藥品監督管理局卻明令所有乳製品的最終形式皆必須經過巴氏殺菌。
這項針對食品安全的聯邦保護出現於一九四九年，那時候的美國經歷過一次與食用生乳起司有關的疾病爆發，而在一九八七年，FDA開始禁止所有生乳產品的販售。儘管幾種熟成須超過六十天的起司不在這項規定內，但是這就意味著，在美國買到的起司，不具歐洲相同類型起司所具備的完整微生物體組合。
蒙貝爾起司也具有益生菌的效用，它可以影響腸道中不屬於起司發酵菌元的細菌含量。法國國家農業研究院（French National Institute for Agricultural Research）的臨床研究顯示食用卡蒙貝爾起司的人，其腸道中稱作屎腸球菌（Enterococcus faecium）的細菌數量會增加。這種細菌不存在於起司中，但是起司的益生菌效用刺激了天然腸道細菌的生長。
所以我們可以視起司為一種食物，既含有自己的微生物體，又能夠經由益生原和益生菌的效果去影響人類腸道的微生物體。起司細菌可以在消化酵素中存活。它們用自己的方式通過整個消化系統，而且可以在食用起司的人的糞便中找到。除了起司對人類微生物體的健康影響外，請牢記有關其鹽分及飽和脂肪含量的警告。
說道健康發酵食物很多人會想到「優格」，研究發現它有哪些好處呢？下一頁揭曉結果！