一篇2021年發表於全球頂尖權威期刊《Cell》的研究，想了解發酵食品可能對腸道與免疫系統造成的影響，並和其他富含豐富膳食纖維的食物（如水果、蔬菜、豆類、全穀類等）進行比較。
這份研究將36個健康成人隨機分成2組。一組被分配吃高纖維的食物，而另一組則要吃優格、酸菜、康普茶、韓式泡菜等發酵食物，為期10周。而研究者則會測量血液中的發炎指標，並追蹤腸道菌種的改變。研究結束時，第一組的膳食纖維攝取量約翻了1倍，從每天約22g增加至45g，而第二組則從幾乎不吃發酵食品，增加至每天吃約6份。
研究結果顯示，兩組民眾的免疫健康都沒有顯著變化，不過，發酵食品組的卻有19種發炎化合物指標下降。有的化合物甚至與糖尿病、類風濕性關節炎有關，而膳食纖維組則沒發現此現象。造成此結果或許與腸道菌相改變相關，吃較多發酵食品的民眾腸道中有更廣泛、更多種的微生物。
這些增加的菌種有5％是來自於發酵食品，史丹佛大學微生物學與免疫學教授、研究作者Justin Sonnenburg推測，其他增加的菌種部分可能來自於原先數量太低、無法被檢查出的菌種；另一部份則可能因發酵食品做了「什麼」，導致其他微生物進入腸道環境，具體生理機制可能仍待後續研究解明。
腸道中的微生物多樣性越豐富，越可降低糖尿病、代謝疾病的風險
腸道中的微生物種類越多、菌相越豐富對民眾來說其實是好事一樁。腸胃科醫師錢政弘醫師曾受訪指出，腸道菌叢越充足、豐富，就越能降低罹患阿茲海默症、帕金森氏症等疾病的風險。
另一篇發表於《Nature》期刊的研究則指出，腸道細菌種類較不豐富民眾，也會比較肥胖，胰島素阻抗、血脂異常、發炎表徵也較明顯。
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