2012年5月份發表在《美國醫學會期刊》(Journal of the American Medical Association)美國蘭德公司(RAND Corporation)的蘇珊•韓培爾(Susanne Hempel)博士及研究人員回顧63項相關研究數據，共分析11,811位各種細菌感染必須服用抗生素的患者，結果發現，病患如果使用抗生素時搭配包括乳酸菌、比菲德氏菌、鏈球菌、酵母菌等益生菌(Probiotics)一起服用，出現腹瀉的機率將會減少42%。
根據統計，通常病患使用抗生素後約有20%的人會腹瀉。而抗生素導致腹瀉的原因可能是：
1.抗生素會刺激腸胃道，引發腸胃蠕動增加，影響腸道對水及電解質的吸收，因而引起腹瀉。
2.抗生素改變腸道內細菌生態的平衡，腸道內的有益菌減少，使得某些產生毒素的有害菌過度繁殖，導致一連串腸胃道不適的症狀。
困難梭狀芽孢桿菌(Clostridium difficile) 是原本就存在腸道內的有害菌，當身體處於健康狀態下，困難梭狀芽孢桿菌並不足以致病。
一旦患者因為細菌感染必需使用抗生素治療時，腸道中的好菌壞菌都被消滅後，具有抗藥性的困難梭狀芽孢桿菌就很容易伺機大量繁殖，造成腹瀉、發燒、脫水、電解質不平衡、腹痛等症狀，嚴重甚至會引發偽膜性大腸炎(pseudomembranous colitis)、毒性巨結腸症(toxic megacolon)等疾病。
腸道內層的黏膜除了吸收養份，也能阻隔病原和過敏原進入血液，益生菌可以使有害菌不易附著在腸黏膜或穿透腸黏膜、進入血液中，而當發生急性腹瀉時，這層保護膜會受損，如果服用益生菌則可加速黏膜修護，縮短腹瀉的時間。